研究报告

杨树响应细菌性溃疡病菌侵染的 miRNA 靶基因预测及分析  

徐千惠1 , 常福利2 , 霍晓薇1 , 周科1 , 王延伟1*
1 北京林业大学, 林木分子设计育种高精尖创新中心, 林木育种国家工程实验室, 林木花卉遗传育种教育部重点实验室, 北京, 100083; 2 焦作管理局, 河南太行山国家级自然保护区, 焦作, 454000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2020年03月16日    接受日期: 2020年03月20日    发表日期: 2021年08月09日
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摘要

欧美杨细菌性溃疡病是由 Lonsdalea quercina subsp. Populi 引起的枝干病害,给杨树的生长和生存带来极大危害。miRNA 是植物响应逆境胁迫的重要调控分子,为鉴定杨树中响应欧美杨细菌性溃疡病菌侵染的 miRNA 靶基因,以期为林木抗病分子育种提供新的候选基因,本研究以 miRBase 数据库中杨树全部miRNA 成熟序列为探针,对‘中林 46’杨接种细菌性溃疡病后的差异表达基因进行了 miRNA 的靶基因预测。共筛选出杨树 127 miRNA 家族的 276 miRNA 对应的 566 个靶基因,涉及植物病原互作、植物激素信号传导和苯丙素生物合成等多个途径,表明 miRNA 参与了杨树对细菌性溃疡病菌侵染的响应。结合靶基因的 GO 分析、KEGG 通路富集和基因功能注释,发现 miR482miR6459miR7812miR7835 miR396 等通过靶定 RPS2NBS-LRRAUX1CCRCa2+ 跨膜运输蛋白编码基因,参与调控杨树对病菌侵染的响应。miR7835 靶定的 9 个差异表达基因中有 6 个基因均编码苯丙素生物合成途径通路中的 CCR 酶,推测其可能影响杨树木质素合成,进而参与杨树对病菌侵染的防御反应。本研究发现的 miRNA:mRNA 调控基因对,丰富了林木抗病分子育种的基因资源,为林木抗病分子调控机制的研究提供了新的线索。

关键词
杨树;miRNA;靶基因;欧美杨细菌性溃疡病菌

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